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探秘T4連接酶:基因“分子縫合針”

發(fā)布時(shí)間:2024-05-22 發(fā)布人:
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       在高中的生物課教材里,就告訴我們基因工程至少需要三種工具:“分子手術(shù)刀”、“分子縫合針”和“分子運(yùn)輸車”。之前我們已經(jīng)了解了“分子手術(shù)刀”——限制性內(nèi)切酶的前世今生,今天我們就來聊聊最常用的“分子縫合針”——T4 DNA連接酶。

 

一、 T4 DNA連接酶來自噬菌體的神秘力量

       1967年,科學(xué)家們?cè)谇秩敬竽c桿菌的T4噬菌體中發(fā)現(xiàn)了一種酶,能夠?qū)嗔训碾p鏈DNA連接起來,于是命名為T4 DNA連接酶。后來發(fā)現(xiàn)T4連接酶不僅能夠連接雙鏈DNA,也能修復(fù)雙鏈DNA、DNA-RNA雜合鏈上的切刻,就像是一套萬能的縫合針。T4 DNA連接酶在縫合DNA時(shí)需要兩端有能穿針的“搭扣”,即3'末端的自由羥基和5'末端的磷酸基團(tuán),同時(shí)還需要ATP參與提供能量。

       因?yàn)橐_連接DNA末端,所以T4 DNA連接酶對(duì)純度要求很高,微量其他核酸酶的污染就會(huì)破壞DNA末端導(dǎo)致連接失敗。愚公&百時(shí)美T4 DNA Ligase (Fast) 經(jīng)過精細(xì)純化,純度與進(jìn)口產(chǎn)品相當(dāng),優(yōu)于國內(nèi)競(jìng)品。

 

二、 不同類型末端的連接效率

       T4 DNA聚合酶可以連接各種類型的雙鏈DNA末端,無論是末端有突出 (overhang) 的粘性末端 (sticky end),還是末端平齊的粘性末端 (blunt end)。

       對(duì)于不同類型的DNA末端,連接效率差異較大。一般而言,粘性末端的連接效率遠(yuǎn)高于平末端;對(duì)于粘性末端,4堿基突出的連接效率高于2堿基突出,但單堿基突出的粘性末端連接效率有時(shí)也接近平末端。根據(jù)我們的數(shù)據(jù),3'突出末端的連接轉(zhuǎn)化效率高于5'突出末端。此外,突出序列CG含量高的連接效率更高。

 

三、 活性定義的差別

       T4 DNA連接酶的用量對(duì)于連接反應(yīng)的效率有很大影響,但不同公司對(duì)T4 DNA連接酶的活性定義方式差別較大。在使用之前一定要仔細(xì)閱讀產(chǎn)品說明書,確保所用的“縫合針”是適合實(shí)驗(yàn)需求的。

下表列出了愚公&百時(shí)美T4 DNA Ligase (Fast)和其他幾種常見T4 DNA連接酶的活性定義和換算比例(根據(jù)各家說明書數(shù)據(jù)),供參考。

 

四、 T4 DNA連接酶使用注意事項(xiàng)

       首先,T4 DNA連接酶比較“嬌貴”,最適反應(yīng)溫度在22℃左右,很容易失活,取用時(shí)一定要注意冰上操作,取完后立即放回-20℃保存。此外,普通T4 DNA連接酶對(duì)Na+、K+等一價(jià)金屬離子的耐受性也比較差。
       其次,T4 DNA連接酶的連接效率受到酶的用量、目的片段與載體濃度及摩爾比、載體大小、DNA純度等因素的影響較大,需要仔細(xì)閱讀說明書,并根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)調(diào)整。
       第三,一定分子量的聚乙二醇 (PEG) 能極大提高平末端的連接效率,可根據(jù)連接反應(yīng)體積的5%酌情添加。

 

愚公&百時(shí)美T4 DNA Ligase (Fast)

01 超高純度

02 連接效率高

03 反應(yīng)快速(室溫下10 min即可完成粘性末端連接)

 

五、 相關(guān)產(chǎn)品

 

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