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聊聊合成生物學(三)——20世紀推動合成生物學發(fā)展的大佬們

發(fā)布時間:2024-08-30 發(fā)布人:
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       談起合成生物學的關(guān)鍵推動人,James Watson和Francis Crick是繞不開的兩座豐碑,他們與Maurice Wilkins因發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)獲得了1962年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎。這項發(fā)現(xiàn)統(tǒng)一了生物學的底層邏輯,被譽為生物學歷史上繼進化論之后最重要的突破。

正在討論DNA雙螺旋模型的 Watson (左) 和 Crick (右)

 
     一鳴驚人之后,Waston一直從事基因相關(guān)的研究,包括重組DNA技術(shù)、癌癥相關(guān)研究,他還是人類基因組計劃的倡導者之一。不過,晚年的Waston經(jīng)常“語出驚人”,頻繁發(fā)表關(guān)于種族(人種)間智商差異的言論而廣受爭議。
       而物理學出身的Crick在發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)之后,投入到蛋白質(zhì)的生物合成研究中,并在1957年首次提出了生物學重要的“中心法則”,成為合成生物學的底層邏輯原則。此后Crick逐步轉(zhuǎn)向神經(jīng)科學的理論研究。

生物學中心法則

 

     當然,讓人意難平的是,在DNA晶體結(jié)構(gòu)X射線衍射研究中上做出杰出貢獻的Rosalind Franklin女士不幸于1958年因病離世,加之當時社會對女性科學家的歧視,未能在有生之年獲得應(yīng)有的認可。

英年早逝的Rosalind Franklin (1921-1958)

有史以來最美的一張X射線照片——DNA晶體X射線衍射照片51號

 

       到20世紀60年代,法國科學家Francois Jacob和Jacques Monod在研究大腸桿菌基因表達時提出了操縱子理論,認為基因表達在細胞內(nèi)是受到嚴格調(diào)控的,奠定了設(shè)計和控制基因表達的理論基礎(chǔ)。1965年他們因“有關(guān)酶的遺傳控制和病毒合成的發(fā)現(xiàn)”而獲得諾貝爾生理學和醫(yī)學獎。

       據(jù)Jacob的妻子回憶:1958年7月的某一天,Jacob與妻子在巴黎看電影時突然顯得有些局促不安,他對妻子說:“我覺得我剛才有了個重要的想法。”他倆于是走出電影院徑直回家。正如Jacob后來所寫的那樣,他領(lǐng)悟到了“那東西的本質(zhì)”。

 

       20世紀60至70年代,瑞士科學家Werner Arber、美國科學家Hamilton Smith和Daniel Nathans先后發(fā)現(xiàn)了限制性內(nèi)切酶及其應(yīng)用(詳見 限制酶的前世今生),為基因工程提供了有力的工具。他們也因此獲得了1978年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎。

 

       1968年,Herbert Boyer從大腸桿菌中分離到了目前最常用的限制酶之一EcoRI。1972年11月,在夏威夷海灘的一家飯館中,一群科學家(包括Herbert Boyer,Stanley Cohen等)在一張餐巾紙上寫下了利用Boyer發(fā)現(xiàn)的限制酶EcoRI和Cohen分離的攜帶抗生素抗性基因質(zhì)粒來進行基因克隆試驗的瘋狂想法。1973年初,他們開始試驗驗證,將EcoRI切割產(chǎn)生的兩種質(zhì)粒DNA片段在體外通過DNA連接酶共價連接,將連接獲得的新質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)入大腸桿菌中,并通過抗生素抗性篩選,獲得了導入外源DNA的大腸桿菌,開創(chuàng)了合成生物學的先河。

餐桌上提出的重組DNA新想法(圖片來源:PNAS)

 

     不過,Stanley Cohen更出名的是關(guān)于細胞生長因子的研究,其研究的EGFR后來成為最重要的癌癥治療靶點,他本人也因此獲得了1986年的諾貝爾生理學或醫(yī)學獎。而Herbert Boyer則更敏銳地抓住了基因重組技術(shù)的商業(yè)價值,1976年,一個失業(yè)的風險投資人Robert Swanson找到并說服了Herbert Boyer,成立了全球第一個生物技術(shù)公司——Genentech (Genetic engineering technology的縮寫)。Herbert Boyer也被譽為“基因工程之父”。

 

       Genentech的第一個產(chǎn)品是只有14個氨基酸的人生長激素抑制素。Boyer從City of Hope醫(yī)院招聘了兩位化學家Arthur Riggs和Keiichi Itakura來完成這個項目。來自日本的Itakura專長合成DNA,Riggs則思維更加活躍。1977年,他們克服重重困難,成功地利用合成的DNA重組表達獲得了人生長激素抑制素。隨后他們迅速開始了生產(chǎn)人胰島素的嘗試。當時與他們競爭的還有另一位大牛,哈佛大學的Walter Gilbert(1980年諾貝爾化學獎得主),但是哈佛大學實驗室受到諸多倫理規(guī)則的限制,反而是采用化學合成DNA的Genentech后來居上。1978年8月,Riggs帶領(lǐng)團隊率先使用大腸桿菌重組生產(chǎn)獲得了人胰島素,1982年獲準上市,使人們擺脫了對天然牛胰臟的依賴,可以大量廉價生產(chǎn)胰島素,造福成千上萬的糖尿病患者。此后,Riggs又主持主導開發(fā)了重組生產(chǎn)人源化單克隆抗體的技術(shù),為治療癌癥、自身免疫性疾病、失明和其他疾病奠定了重要基礎(chǔ)。目前全球年銷售額前10的藥物中,半數(shù)以上都是單克隆抗體藥物。雖然Genentech于2009年被Roche收購,成為Roche子公司,但生物技術(shù)老大哥的傳說仍然在江湖上延續(xù)。

工作中的Arthur Riggs(右)和Keiichi Itakura(左)

 

       Riggs的這兩項杰出貢獻,直接促成了價值至少5000億美元的生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)啟動,成為合成生物學產(chǎn)業(yè)化的奠基人。更令人欽佩的是,Riggs博士除了致力于科研(他還是表觀遺傳學的先驅(qū)之一),還悄悄貢獻了幾乎全部發(fā)明創(chuàng)造所帶來的財富(他曾經(jīng)向?qū)W生自嘲:“我這輩子都在錢里洗澡”)。在過去的30年,Riggs博士個人向City of Hope醫(yī)院捐贈共計超過3.1億美元。

       當基因工程發(fā)展如火如荼的時候,準確高效的DNA測序成為迫切需要解決的問題。1977年,F(xiàn)rederick Sanger發(fā)明了雙脫氧鏈終止DNA測序法,成為第一代DNA測序的核心技術(shù)。這位大佬是個富二代,但并不是天縱奇才,博士畢業(yè)后求職時因為沒有亮點成果,只好給教授們說當自帶干糧、不拿工資的實驗員。沒想到,從此大力出奇跡,埋頭做實驗的Sanger先后發(fā)明了蛋白質(zhì)測序技術(shù)和雙脫氧終止DNA測序技術(shù),從而于1958年和1980年兩次摘得諾貝爾化學獎(如果不是慢了一步,1968年的諾貝爾生理學或醫(yī)學獎可能也是他),成為歷史上第4位兩次獲得諾貝爾獎的大牛。他有兩名學生也獲得了諾貝爾獎。

       1983年的一天,正在做實驗的Sanger突然感到自己已經(jīng)老了,于是停下工作,走出實驗室關(guān)上門,宣布退休,給世界留下了一個瀟灑離去的背影。

退休后在自家花園的Frederick Sanger

 

       DNA測序得到了解決,下一步就是如何快速大量獲得DNA片段。從小就吊兒郎當,但天資聰穎的Kary Mullis橫空出世。這位爺在本科學的是化學專業(yè),經(jīng)常自己合成致幻劑;研究生選擇了生物化學專業(yè),但其實并不太懂生物。一次嗑藥之后,Mullis眼前出現(xiàn)了整個宇宙,仿佛看到了宇宙的源頭,從幻覺中清醒過來后的Mullis迅速提筆記下在幻覺中看到的一切,最終寫成了論文投給Nature,居然還發(fā)表了,于是稀里糊涂拿到了博士學位。

       畢業(yè)之后的Mullis蹉跎了幾年,進入一家生物公司Cetus工作。1983年春天的一個夜晚,磕過藥的Mullis帶著女友在公路上兜風,一個念頭突然出現(xiàn)在他的腦海中——擴增DNA片段時,如果同時添加兩條引物,分別擴增正義鏈和反義鏈,那么只要引物足夠,豈不是可以無限循環(huán)地擴增下去!Mullis驚呆了,這么簡潔的思路居然從來沒人想到過!但是,拖延癥嚴重的Mullis直到1983圣誕節(jié)前才成功完成了第一次聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)。PCR技術(shù)使人們可以方便、快速獲得大量DNA片段,是生物學的革命性技術(shù),Mullis也因此獲得1993年諾貝爾化學獎。

Kary Mullis

 

     這些科學先驅(qū)在20世紀的努力,從理論和技術(shù)上都為合成生物學的誕生奠定了重要的基礎(chǔ)。在世紀之交,現(xiàn)代意義上的合成生物學已經(jīng)呼之欲出。

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