新品上市 l 熱敏UDG/UNG
熱敏UDG/UNG——高效去除擴(kuò)增產(chǎn)物氣溶膠污染
在核酸檢測、司法鑒定、食品檢測等分子診斷實(shí)驗(yàn)室中,經(jīng)常使用PCR或環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增 (LAMP) 等技術(shù)大量擴(kuò)增同類樣品,由擴(kuò)增產(chǎn)物散逸形成的氣溶膠所導(dǎo)致的PCR假陽性問題帶來很大困擾。使用尿嘧啶-DNA糖基化酶 (Uracil-DNA Glycocasylase) 去除擴(kuò)增產(chǎn)物氣溶膠污染是目前較為安全和有效的方法。
UDG作用原理
在DNA擴(kuò)增反應(yīng)底物dNTPs中摻入dUTP,擴(kuò)增的DNA產(chǎn)物中即含有dU。如果反應(yīng)體系被含有dU的外來擴(kuò)增產(chǎn)物氣溶膠污染,在擴(kuò)增反應(yīng)之前,UDG可在常溫下催化水解外來DNA鏈中的尿嘧啶堿基和脫氧核糖骨架之間的N-糖苷鍵,產(chǎn)生缺堿基 (AP) 位點(diǎn),然后將UDG失活。在隨后擴(kuò)增反應(yīng)的高溫下,含有AP位點(diǎn)的DNA骨架水解斷裂,從而降解了外來擴(kuò)增產(chǎn)物。而本次新加入的反應(yīng)模板不含dU,不受UDG影響。
愚公百時(shí)美——熱敏UDG
性能展示:
圖1 HL-UDG 在50℃下徹底不可逆失活。A:將1 U的HL-UDG分別在50℃、70℃、95℃條件下孵育10min后與含dU底物25℃下反應(yīng)。消化的底物電泳條帶無明顯變化。B:該酶50℃ 下5min、10min失活后的熒光值均與不加UDG的熒光值接近。
2、 保持PCR產(chǎn)物的完整性
圖2 HL-UDG不影響PCR產(chǎn)物的完整性。A:在PCR體系中加HL-UDG,在37℃下孵育0、1、2、4、6、8h,凝膠電泳結(jié)果顯示加或不加HL-UDG,PCR產(chǎn)物條帶無明顯變化。B:在PCR體系中加HL-UDG,37℃下孵育8h的PCR產(chǎn)物測序結(jié)果顯示序列完整。
3、 兼容qPCR體系&消化徹底
圖3 HL-UDG兼容qPCR體系&消化徹底。A:在模板為不含有dUTP的qPCR體系加入HL-UDG 與不加入的擴(kuò)增效果一致。B:qPCR體系中加入不同濃度的含dU模板均被徹底消化,不起峰。
1、 控制PCR、qPCR、RT-PCR、RT-qPCR、LAMP中的擴(kuò)增產(chǎn)物氣溶膠污染。
2、DNA 修復(fù)和突變檢測研究。
3、提升 PCR 產(chǎn)物的克隆效率。
4、提升定點(diǎn)突變的效率。
5、蛋白-DNA 相互作用研究。